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蛋白組+代謝組聯(lián)合分析

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蛋白組+代謝組聯(lián)合分析

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項目介紹

     代謝組學(xué)可以研究某一生物、組織或細胞在特定環(huán)境下的特定時期內(nèi)所有低分子量代謝產(chǎn)物。相比其他組學(xué)，代謝組與表型有著更近的聯(lián)系。蛋白組和代謝組緊密聯(lián)系，蛋白水平會影響代謝產(chǎn)物的表達譜，而代謝物濃度又會影響蛋白表達量。代謝組學(xué)分析可以幫助蛋白組數(shù)據(jù)在功能上進行解釋；而蛋白質(zhì)組學(xué)分析通過突出參與的酶或酶促途徑，有助于更好地理解代謝組學(xué)數(shù)據(jù)。蛋白組學(xué)與代謝組學(xué)整合分析能夠更好地解釋疾病或外界刺激的分子機理和不同組學(xué)對通路的調(diào)控機制，更直觀地了解代謝物、酶及基因之間上下游的調(diào)控關(guān)系。

分析方法

      篩選出差異表達的蛋白和代謝小分子，基于O2PLS關(guān)聯(lián)分析進行多變量整合分析。對差異蛋白與差異代謝小分子進行斯皮爾曼（Spearman）相關(guān)性分析，并進一步構(gòu)建相關(guān)性網(wǎng)絡(luò)。然后，將差異蛋白和差異代謝小分子映射到iPath 整體代謝通路和KEGG 通路上，并進行KEGG 富集分析。最后，利用Cytoscape 中的Metscape 插件進行蛋白組和代謝組的互作網(wǎng)絡(luò)分析。

樣品要求

詳情請聯(lián)系技術(shù)經(jīng)理。

項目案例

蛋白組和代謝組的差異統(tǒng)計結(jié)果柱狀圖

蛋白組（A）和代謝組（B）的差異分析火山圖

差異蛋白與差異代謝物表達相關(guān)性熱圖

蛋白與代謝物的共表達關(guān)系網(wǎng)絡(luò)圖

學(xué)術(shù)文章

蛋白組+代謝組聯(lián)合分析

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